當(dāng)凍干機(jī)的運(yùn)行成本占總產(chǎn)值的比例較大時(shí)，降低運(yùn)行成本和提高生產(chǎn)效率尤為重要。影響冷凍干燥機(jī)運(yùn)行成本的因素主要有三個(gè)方面：
1.來(lái)自材料的影響，例如共晶點(diǎn)、熱敏性、幾何尺寸或厚度，將對(duì)所需的干燥時(shí)間和操作成本產(chǎn)生很大影響；
2.*終凍結(jié)溫度、凍結(jié)速率、加熱溫度、加熱速率和加熱時(shí)間等工藝路線對(duì)干燥速度和操作成本都有影響。
3.凍干機(jī)本身的影響。冷凍干燥機(jī)的性能、極限參數(shù)指標(biāo)、綜合能力、能量利用率、運(yùn)行穩(wěn)定性、控制難度等都會(huì)對(duì)干燥效率和運(yùn)行成本產(chǎn)生影響，甚至嚴(yán)重影響。

降低企業(yè)運(yùn)行管理成本的若干途徑：
1.一般成分比較簡(jiǎn)單的物料共晶點(diǎn)較高，如蔬菜等凍結(jié)溫度只有-15℃左右，凍結(jié)時(shí)間較短，相應(yīng)加熱時(shí)間也短，能源消耗相對(duì)較少，運(yùn)行成本較低。而成分進(jìn)行復(fù)雜，含有一些諸如鹽、糖、脂肪、氨基酸、溶劑等有機(jī)或無(wú)機(jī)化學(xué)成分的物料共晶點(diǎn)較低，凍結(jié)溫度越低，凍結(jié)發(fā)展時(shí)間越來(lái)越長(zhǎng)，相應(yīng)加熱處理時(shí)間也越長(zhǎng)，運(yùn)行管理成本水平越高。
2.一些生物產(chǎn)品如菌類(lèi)等物料熱敏感度非常高，加熱溫度不允許過(guò)高(-15℃~30℃，吸收熱量困難，所以需要干燥時(shí)間很長(zhǎng)，運(yùn)行成本會(huì)很高。而熱敏感度不高的物料（如普通食品）加熱溫度可以很高（75℃~100℃），干燥時(shí)間會(huì)大大縮短，運(yùn)行成本會(huì)很低。
3.相同重量下，幾何尺寸越小，薄而松的物質(zhì)冰表面積越大，越有利于升華，干燥時(shí)間越短。如將較大塊的物料分切或破碎成較小的碎塊，可大大提高升華進(jìn)行干燥處理速度，降低企業(yè)運(yùn)行管理成本。
4.在裝料量和設(shè)備功耗一定的條件下，減少產(chǎn)品裝料厚度，適當(dāng)增加干貨架面積，可以提高干貨架的傳熱能力，縮短冷凍和加熱干燥時(shí)間，降低運(yùn)行成本，但設(shè)備投資略有增加。